Zagadnienie cen transferowych pojawiło się w latach 60. XX wieku, najpierw na poziomie poszczególnych krajów (np. amerykańskie wytyczne dla transakcji między podmiotami powiązanymi w 1968 r.), a wobec pojawienia się sytuacji przerzucania obciążeń podatkowych między krajami wkrótce później na poziomie międzynarodowym.
Obecnie, temat cen transferowych jest przedmiotem zainteresowania kilku organizacji międzynarodowych, których opracowania i standardy wniosły wkład w różne aspekty rozliczeń transakcji między podmiotami powiązanymi i znalazły zastosowanie w krajowych przepisach, w tym polskich.